Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms