Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms