Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nlrp9bQ66X22 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9bQ66X22 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms