Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CcncQ62447 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms