Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp4Q62445 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms