Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms