Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sim2Q61079 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sim2Q61079 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sim2Q61079 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sim2Q61079 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sim2Q61079 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sim2Q61079 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sim2Q61079 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sim2Q61079 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sim2Q61079 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sim2Q61079 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sim2Q61079 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms