Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Neurod1Q60867 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms