Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms