Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms