Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms