Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms