Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms