Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp3Q3ULW8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp3Q3ULW8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms