Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gpr55Q3UJF0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gpr55Q3UJF0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpr55Q3UJF0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms