Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zswim8Q3UHH1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zswim8Q3UHH1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zswim8Q3UHH1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zswim8Q3UHH1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zswim8Q3UHH1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zswim8Q3UHH1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zswim8Q3UHH1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zswim8Q3UHH1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zswim8Q3UHH1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms