Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q3U6N9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Q3U6N9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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