Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms