Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms