Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spatc1Q148B6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms