Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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