Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms