Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms