Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crmp1P97427 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms