Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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SgcgP82348 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcgP82348 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcgP82348 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcgP82348 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SgcgP82348 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SgcgP82348 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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