Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms