Protein–RNA interactions for Protein: P63005

Pafah1b1, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b1P63005 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pafah1b1P63005 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms