Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pex2P55098 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pex2P55098 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms