Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms