Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lbx1P52955 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lbx1P52955 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lbx1P52955 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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