Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MipP51180 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MipP51180 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MipP51180 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms