Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs12P50716 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms