Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FmodP50608 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FmodP50608 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FmodP50608 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FmodP50608 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FmodP50608 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FmodP50608 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms