Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CitP49025 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CitP49025 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms