Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcd1P48410 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms