Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.8 ms