Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Mmp9P41245 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Mmp9P41245 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp9P41245 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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