Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CskP41241 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CskP41241 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CskP41241 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CskP41241 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CskP41241 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CskP41241 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms