Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfc1P35601 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms