Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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