Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc1P29341 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms