Protein–RNA interactions for Protein: P16332

Mut, Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MutP16332 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MutP16332 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MutP16332 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MutP16332 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MutP16332 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms