Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms