Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SparcP07214 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SparcP07214 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SparcP07214 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SparcP07214 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms