Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prp2P05143 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms