Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01878 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01878 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01878 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01878 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01878 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01878 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01878 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms