Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01853 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01853 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01853 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01853 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01853 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01853 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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