Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01747 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P01747 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01747 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms