Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01679 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01679 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01679 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01679 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01679 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01679 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01679 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01679 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01679 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01679 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01679 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01679 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms