Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01672 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01672 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01672 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01672 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01672 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01672 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01672 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01672 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01672 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01672 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01672 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01672 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01672 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms